Большой импульс поиску лекарств и вакцин может дать ответ на несколько простых вопросов о происхождении коронавируса, которые все еще остаются под вопросом. У каких видов животных впервые проявился коронавирус Covid-19.? Летучая мышь, панголин или другой дикий вид? Откуда это взялось? Из пещеры (или леса) в китайской провинции Хубэй или где-то еще?
В декабре 2019 г., 27 из первых 41 человека, госпитализированных в больницу (66%), прошли через рынок, расположенный в самом центре города Ухань, провинция Хубэй. Но, по словам одного исследование, проведенное в больнице Уханя и опубликованное в Lancet первый выявленный случай с людьми не посещал этот рынок.
Оценка молекулярного датирования на основе геномных последовательностей SARS-CoV-2 его происхождение восходит к ноябрю. И это вызывает вопросы о происхождении коронавируса, особенно о связи между этой эпидемией COVID-19 и дикой природой.
Геномные данные
Il SARS-CoV-2 геном является был «быстро» секвенирован китайскими исследователями. Геномный анализ сравнительные исследования показали, что SARS-CoV-2 относится к группе betacoronavirus и это очень близко к SARS-коронавирус, ответственный за эпидемию острой пневмонии, которая возникла в ноябре 2002 года в китайской провинции Гуандун, а затем распространилась на 29 стран в 2003 году. ТОРС зарегистрировано 8.098 774 случаев, в том числе XNUMX случая смерти. Такие летучие мыши, как известно, Rhinolophus были резервуар этого вируса и что маленький хищник, циветта ладони (личинка пагума), это могло быть сделано с промежуточный гость между летучими мышами и первыми человеческими случаями.
С тех пор многие betacoronavirus были обнаружены в основном у летучих мышей, но также и у людей. Например, RaTG13, выделенный из летучей мыши вида Rhinolophus Affinis собранный в китайской провинции Юнань, недавно был описан как очень похожий на SARS-CoV-2, с 96% идентичных последовательностей генома .
Эти результаты показывают, что летучие мыши, и особенно виды рода Rhinolophus, составляют резервуар вирусов SARS-CoV и SARS-CoV-2.
Но как вы определяете танк? Резервуар — это один или несколько видов животных, которые мало или совсем не восприимчивы к вирусу, но являются его носителями. Отсутствие симптомов заболевания объясняется эффективностью иммунной системы этих животных, которая позволяет им бороться с вирусным размножением.
Механизм рекомбинации
7 Февраль 2020 Позже наука узнала, что у панголина был обнаружен вирус, еще более близкий к SARS-CoV-2. С 99% геномное соответствиепанголин считался более вероятным танком, чем летучие мыши.
Все обосновались на происхождении коронавируса, тогда? Еще нет.
Впоследствии один самое последнее исследование и все еще расследуется показывает, что геном коронавируса, выделенный из малазийского ящера (Манис Яваница) меньше похож на SARS-Cov-2, только с 90% геномного соответствия. Это указывает на то, что вирус, выделенный у панголина, не несет ответственности за бушующую в настоящее время вспышку COVID-19.
Белок С
Однако коронавирус, выделенный из панголина, на 99% схож по 74 аминокислотам, участвующим в связывающем домене рецептора ангиотензина II, что позволяет вирусу проникать в клетки человека и инфицировать их. Напротив, вирус RaTG13, выделенный от летучих мышей. ринолофус аффинис он сильно расходится в этой специфической части (сходство только 77%). На практике коронавирус, выделенный из ящера, способен проникать в клетки человека, тогда как тот, который выделен из летучей мыши ринолофус аффинис это не.
Кроме того, эти геномные сравнения предполагают, что вирус SARS-Cov-2 является результатом рекомбинации двух разных вирусов, один из которых близок к RaTG13, а другой ближе к вирусу панголина. Другими словами, это будет химера между двумя ранее существовавшими вирусами.
Этот механизм рекомбинации был уже было описано в коронавирусах, в частности для объяснения происхождения SARS-CoV. Важно знать, что результатом рекомбинации является новый вирус, потенциально способный инфицировать новый вид-хозяин.
Чтобы произошла рекомбинация, два расходящихся вируса должны были инфицировать один и тот же организм одновременно.
Остаются без ответа два вопроса: в каком организме произошла эта рекомбинация? (летучая мышь, панголин или другой вид?) И, прежде всего, при каких условиях произошла эта рекомбинация?
