Прежде чем врач сможет лечить пациента, он должен знать, что с ним не так, верно?
Это не так сложно, если проблема заключается в ветряной оспе или вывихе лодыжки, но инфекции бывает намного сложнее обнаружить с помощью диагностического теста. Например, вирусная пневмония и бактериальная пневмония вызывают похожие симптомы, но могут потребовать разных методов лечения.
Всем известна проблема: диагностический тест предназначен для поиска только вируса, бактерии или другого конкретного патогена в конкретном типе образца, таком как кровь или моча.
Для анализа каждого диагностического теста требуется время, и если первый раунд тестов окажется безрезультатным, врачу может потребоваться назначить еще один. Вкратце: пациенты, проходящие иногда инвазивный процесс сбора образцов, и задержки в лечении.
Универсальный диагностический тест
Ученые Калифорнийского университета в Сан-Франциско они утверждают, что разработали единый диагностический тест, который может искать любой тип образца ДНК на предмет известных патогенов и предоставлять результаты всего за шесть часов.
У нас уже есть тесты, которые ищут в образце генетический код вирусов или бактерий. Пример превыше всего? Наиболее часто используемый диагностический тест на COVID-19 (называемый RT-PCR-тестом) основан на поиске РНК коронавируса.
Исследователи Калифорнийского университета в Сан-Франциско разработали диагностический тест, который начинается с секвенирования всей ДНК, присутствующей в образце (человеческой, вирусной, бактериальной и грибковой), с использованием существующей методики, называемой метагеномное секвенирование нового поколения (mNGS).
Затем программа просматривает всю ДНК, отыскивая совпадения в базе данных для каждого известного патогена: найдите совпадение, и вы узнаете, что патоген заразил пациента.
Просто и революционно
Универсальность универсального диагностического теста очевидна сразу. Врач может выбрать любой тип образца, который с наибольшей вероятностью может содержать возбудитель (например, легочную жидкость для пациента с признаками пневмонии). Однако вам больше не придется беспокоиться об использовании анализа, предназначенного для работы с конкретным типом проб.
исследование
Ранее исследователи показали, что их метод может быть использован для обнаружения РНК-вирусов из различных жидкостей организма. В своем последнем исследовании опубликовано в Nature Medicine, решили сосредоточиться на диагностическом тесте, который может идентифицировать ДНК бактерий и грибов.
Для начала исследователи использовали свой диагностический тест, чтобы проанализировать 180 образцов жидкости организма 160 пациентов. Эти образцы уже подвергались регулярным диагностическим тестам с использованием двух традиционных методов: теста на культуру (попытка выращивания микробов в чашке Петри) и тестов ПЦР.
Исследователи использовали две разные технологии для создания своих последовательностей: секвенирование нанопор, который может принести результаты всего за шесть часов, а Секвенирование Illumina, который может обрабатывать множество образцов, но занимает более 24 часов.
Оба метода соответствовали диагностике традиционных методов примерно в 75% бактериальных инфекций и 91% грибковых инфекций.
Разработчик диагностических тестов Чарльз Чиу с секвенсором. Предоставлено: Элизабет Фолл.
Новый тест можно первоначально использовать после того, как пациент дал отрицательный результат другими стандартными методами. На расстоянии, если он эффективен, универсальный диагностический тест может вытеснить большинство существующих.
